1、DH5菌株

用途:克隆菌，用于分子克隆、質粒提取。

基因型:supE44△lacU169（?80lacZ△M15）

       hsdR17 recAl endAl gyrA19

       thi-1 relAl

特點:一種用于鋪制與培養質粒平板和粘性平板的抑制型菌株.其?80lacZ△M15基因的產物可與pUC載體編碼的β-半乳糖苷酶氨基端實現α互補，可用于藍白斑篩選。recAl和endAl的突變有利于克隆DNA的穩定和高純度質粒的提取。

2、TOP-10菌株

用途：克隆菌，用于分子克隆，質粒提取。

基因型：F_ mcrAΔ(mrr-hsd RMS-mcrBC) φ80 lacZΔM15△lacⅩ74 recA1 deoRaraD139Δ(ara-leu)7697 galU galK rpsL (StrR) endA1 nupG

特點：一種用于鋪制與培養質粒平板和粘粒平板的重級缺陷的抑制型菌株。其中φ80 lacZΔM15基因的產物可與pUC載體編碼的β-半乳糖苷酶氨基端實現α-互補，可用于藍白斑篩選。該菌株適用于高效的DNA克隆和質粒擴增，能保證高拷貝質粒的穩定遺傳。

3、JM109菌株

用途：克隆菌，用于分子克隆。

基因型：recAl supE44 endAl hsdR17

       Gyr A96 relAl thiΔ(lac-proAB )

       F’[traD36 proAB+ lacZ△M15]

特點：一種支持帶有琥珀突變的載體生長的重組缺陷的抑制型菌株，對轉染的DNA有修飾作用而無限制作用。

4、BL21(DE3)菌株

用途：表達菌，可用于表達非毒性蛋白

基因型：hsdSgal (c I TS857indl Sam7 nin5 lacUV5-T7)

特點：該菌株用于高效表達克隆于含有T7噬菌體啟動子的表達載體的基因。T7噬菌體RNA聚合酶位于噬菌體DE3區，該區整合于BL21染色體上

5、BL21(DE3)pLysS菌株

用途：表達菌，可表達毒性蛋白和非毒性蛋白。

基因型：F-, ompT hsd（rBB-mB-），gal，dcm（DE3, pLysS,Camr）

特點：pLysS菌株含有pLysS質粒，因此具有氯霉素抗性。pLysS質粒含有表達T7溶菌酶的基因，能夠降低目的基因的背景表達水平，但不干擾目的蛋白的表達。